聖書宣教会では、以下のコース(フルタイムの学び)と、拡大教育が設けられています。
伝道者としての召命が明確であり、卒業後は牧会者・宣教師・伝道者としての働きを目指す方のためのコースです。旧・新約聖書を、原語(ヘブル語・ギリシャ語)で学び、聖書に対する理解を深め、聖書的・神学的視点から福音宣教と教会形成を行うことのできる働き人を育てます。研修生活や寮(単身寮・家族寮)生活を通しての訓練、奉仕教会等での実践的な訓練も重視されています。
伝道者としての召命が明確であり、卒業後は教会の多様な働きにつくことを目指す方のためのコース・専攻です。聖書語学はギリシャ語かヘブル語のいずれか一つを選択し、聖書や神学の諸学科を学びます。研修生活や寮生活を通しての訓練、奉仕教会等での実践的な訓練は聖書神学舎本科と同じです。
伝道者としての召命が明確であり、卒業後は伝道者として、また教会音楽奉仕者として主の教会に仕えることを目指す方のためのコース・専攻です。聖書神学舎聖書科・聖書専攻における聖書の学びに加えて、聖書に基づく教会音楽の理論と実技とを学びます。研修生活や寮生活を通しての訓練、奉仕教会等での実践的な訓練は聖書神学舎本科と同じです。
既に聖書神学舎、旧教会音楽舎のフルタイムのコースを終了していて(あるいはそれと同等の学力を有していて)、更にフルタイムで学びを継続したい方のためのコースです。
単独のコースではありませんが、教会に仕えるための学びとして、教会から祈られて送り出される方に、聴講の機会があります。
信徒の方のための拡大教育、および卒業生向けの継続教育があります。